- O Mistério da Estrada de Sintra (1870)
- O Crime do Padre Amaro (1875); versão definitiva em 1880
- O Primo Basílio (1878)
- O Mandarim (1880)
- A Relíquia (1887)
- Os Maias (1888)
- Uma Campanha Alegre (1890-91)
- A Ilustre Casa de Ramires (1900)
- A Correspondência de Fradique Mendes (1900)
- A Cidade e as Serras (1901)
- Contos (1902)
- Prosas Bárbaras (1903)
- Cartas de Inglaterra (1905)
- Ecos de Paris (1905)
- Cartas Familiares (1907)
- Bilhetes de Paris (1907)
- Notas Contemporâneas (1909)
- Últimas páginas (1912)
- A Capital (1925)
- O Conde de Abranhos (1925)
- Alves e C.ª (1925)
- Correspondência (1925)
- O Egipto (1926)
- Cartas Inéditas de Fradique Mendes (1929)
- Páginas Esquecidas (1929)
- Eça de Queirós entre os seus - Cartas íntimas (1949)
- Folhas Soltas (1966)
- A Tragédia da Rua das Flores (1980)
- Dicionário de Milagres
- Lendas de Santos
EDIÇÕES CRÍTICAS:
- A Capital (1992)
- O Mandarim (1993)
- Alves e C.ª (1994)
- Textos de Imprensa VI (1995)
